Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRGMA1A4Y4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGMA1A4Y4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRGMA1A4Y4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRGMA1A4Y4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRGMA1A4Y4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRGMA1A4Y4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRGMA1A4Y4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms