Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX0

CIB4, Calcium and integrin-binding family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB4A0PJX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIB4A0PJX0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIB4A0PJX0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB4A0PJX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIB4A0PJX0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIB4A0PJX0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms