Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBA6A0AVT1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBA6A0AVT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA6A0AVT1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA6A0AVT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBA6A0AVT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms