Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM129A0AVI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM129A0AVI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM129A0AVI4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM129A0AVI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM129A0AVI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM129A0AVI4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms