Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00854A0A1B0GVQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00854A0A1B0GVQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00854A0A1B0GVQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms