Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms