Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A0J9YXV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0J9YXV3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms