Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms