Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG2

TRBV6-6, T-cell receptor beta variable 6-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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