Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Gm28171A0A087WQ19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Gm28171A0A087WQ19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm28171A0A087WQ19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Gm28171A0A087WQ19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Gm28171A0A087WQ19 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Gm28171A0A087WQ19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28171A0A087WQ19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Gm28171A0A087WQ19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28171A0A087WQ19 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Gm28171A0A087WQ19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Gm28171A0A087WQ19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gm28171A0A087WQ19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm28171A0A087WQ19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm28171A0A087WQ19 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm28171A0A087WQ19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28171A0A087WQ19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm28171A0A087WQ19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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