Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Plod3Q9R0E1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms