Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PnckQ9QYK9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PnckQ9QYK9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms