Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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