Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms