Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp2c55Q9D816 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms