Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lactb2Q99KR3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms