Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms