Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup214Q80U93 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms