Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms