Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms