Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.036e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.666e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.956e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.116e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.196e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.226e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-212ENST00000518306 755 ntTSL 57.24□□□□□ -1.256e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 54.59□□□□□ -1.676e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 43.71□□□□□ -1.826e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASGR1-206ENST00000573596 2083 ntTSL 516.89■□□□□ 0.296e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.166e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.266e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ASGR1-205ENST00000573083 855 ntTSL 39.82□□□□□ -0.846e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)19.16■□□□□ 0.662e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 414.06□□□□□ -0.161e-20■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-20■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.171e-20■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.72e-13■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.958e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.768e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.318e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.288e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RAB11FIP3-208ENST00000464263 329 ntTSL 315□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LMO7-217ENST00000525914 874 ntTSL 513.89□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RAB11FIP3-207ENST00000461009 514 ntTSL 213.02□□□□□ -0.338e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 C11orf58-202ENST00000524439 405 ntTSL 312.99□□□□□ -0.338e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.338e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.338e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 311.08□□□□□ -0.648e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 UBE3C-203ENST00000430750 448 ntTSL 411□□□□□ -0.658e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.59□□□□□ -0.718e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.728e-6■□□□□ 10.6
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TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.498e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 C11orf58-210ENST00000531658 4258 ntTSL 1 (best)5.23□□□□□ -1.578e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.648e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 C11orf58-203ENST00000524461 2040 ntTSL 24.07□□□□□ -1.768e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RACK1-207ENST00000503170 461 ntTSL 416.57■□□□□ 0.245e-50■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RACK1-232ENST00000514318 581 ntTSL 316.12■□□□□ 0.175e-50■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.7□□□□□ -1.55e-50■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-203ENST00000518194 450 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 10.6
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TRA2AQ13595 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 NPM1-206ENST00000519955 571 ntTSL 24.6□□□□□ -1.674e-6■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 CHD2-209ENST00000627185 533 ntTSL 37.56□□□□□ -1.21e-8■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 324.83■■□□□ 1.574e-9■□□□□ 10.5
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TRA2AQ13595 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.75e-6■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.233e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.743e-7■□□□□ 10.5
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TRA2AQ13595 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.274e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 517.85■□□□□ 0.456e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 517.7■□□□□ 0.426e-7■□□□□ 10.5
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TRA2AQ13595 ERCC3-206ENST00000462306 963 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.076e-7■□□□□ 10.5
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TRA2AQ13595 ERCC3-209ENST00000494464 1367 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.336e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ERCC3-202ENST00000426778 2916 ntTSL 212.15□□□□□ -0.466e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.476e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ERCC3-203ENST00000445889 2920 ntTSL 211.87□□□□□ -0.516e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 SPATS2L-210ENST00000421573 600 ntTSL 59.97□□□□□ -0.816e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.946e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.096e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 45.85□□□□□ -1.476e-7■□□□□ 10.5
TRA2AQ13595 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.165e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PHRF1-204ENST00000532550 748 ntTSL 317■□□□□ 0.315e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.145e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.115e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 515.51■□□□□ 0.075e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.015e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.345e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 DNAJC21-206ENST00000514237 1038 ntTSL 1 (best)7.87□□□□□ -1.155e-8■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.663e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-211ENST00000592700 1602 ntTSL 218.01■□□□□ 0.473e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.243e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 10.4
TRA2AQ13595 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 10.4
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