Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 NSL1YPL233W 651 nt2.83□□□□□ -1.96
HER1Q12276 PFF1YBR074W 2931 nt2.83□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.82□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YDR413CYDR413C 576 nt2.82□□□□□ -1.96
HER1Q12276 VTI1YMR197C 654 nt2.82□□□□□ -1.96
HER1Q12276 RPL23AYBL087C 414 nt2.82□□□□□ -1.96
HER1Q12276 snR65snR65 100 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YDL068WYDL068W 330 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 RRT13YER066W 558 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YER097WYER097W 330 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YOR385WYOR385W 873 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 NDT80YHR124W 1884 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YOL057WYOL057W 2136 nt2.81□□□□□ -1.96
HER1Q12276 RAX2YLR084C 3663 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 NTO1YPR031W 2247 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 JJJ2YJL162C 1752 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 CWC22YGR278W 1734 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 OST1YJL002C 1431 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YGR025WYGR025W 303 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 SIP18YMR175W 240 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 URA10YMR271C 684 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 snR13snR13 124 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YPL080CYPL080C 327 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 UTP14YML093W 2700 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 NIC96YFR002W 2520 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 MKT1YNL085W 2493 nt2.8□□□□□ -1.96
HER1Q12276 SRB8YCR081W 4284 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 GCD10YNL062C 1437 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 HMRA2YCR096C 360 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YHL005CYHL005C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YOR146WYOR146W 306 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YPL039WYPL039W 951 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 ROX1YPR065W 1107 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 RPA190YOR341W 4995 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 MES1YGR264C 2256 nt2.79□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YJR003CYJR003C 1560 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 ALY1YKR021W 2748 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 SWT1YOR166C 1377 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 SIN3YOL004W 4611 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 snR8snR8 190 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 MCM22YJR135C 720 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YAR068WYAR068W 486 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 LSM2YBL026W 288 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 ATP3YBR039W 936 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 GEA1YJR031C 4227 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 ECM29YHL030W 5607 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 DIE2YGR227W 1578 nt2.78□□□□□ -1.96
HER1Q12276 YGR067CYGR067C 2415 nt2.78□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YLR001CYLR001C 2589 nt2.77□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SLP1YOR154W 1764 nt2.77□□□□□ -1.97
HER1Q12276 DGK1YOR311C 873 nt2.77□□□□□ -1.97
HER1Q12276 TFB1YDR311W 1929 nt2.77□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YPP1YGR198W 2454 nt2.77□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SEC7YDR170C 6030 nt2.77□□□□□ -1.97
HER1Q12276 HEH2YDR458C 1992 nt2.76□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPL29YFR032C-A 180 nt2.76□□□□□ -1.97
HER1Q12276 HOP2YGL033W 657 nt2.76□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.76□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YPR203WYPR203W 309 nt2.76□□□□□ -1.97
HER1Q12276 BIT61YJL058C 1632 nt2.75□□□□□ -1.97
HER1Q12276 TIM11YDR322C-A 291 nt2.75□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YGR107WYGR107W 450 nt2.75□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.75□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPL8BYLL045C 771 nt2.75□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YAR029WYAR029W 225 nt2.75□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SSN2YDR443C 4263 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 KIN82YCR091W 2163 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 ECM21YBL101C 3354 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YDR102CYDR102C 333 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 ATP17YDR377W 306 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RAD6YGL058W 519 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YIL012WYIL012W 342 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPS22AYJL190C 393 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 PET191YJR034W 327 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 JIP3YLR331C 378 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPB11YOL005C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SLM6YBR266C 453 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 DUG2YBR281C 2637 nt2.74□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YIL169CYIL169C 2988 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 FAA2YER015W 2235 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RIF1YBR275C 5751 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 JSN1YJR091C 3276 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 AAD16YFL057C 459 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 PAU23YLR037C 375 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPL6AYML073C 531 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 RPS7BYNL096C 573 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YBL108WYBL108W 306 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 ARK1YNL020C 1917 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 GYP7YDL234C 2241 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SPC72YAL047C 1869 nt2.73□□□□□ -1.97
HER1Q12276 FIR1YER032W 2631 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 SAP1YER047C 2694 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 ESL2YKR096W 3588 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 GPI8YDR331W 1236 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 NOP19YGR251W 591 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YIL174WYIL174W 228 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.72□□□□□ -1.97
HER1Q12276 AIM32YML050W 936 nt2.72□□□□□ -1.97
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