Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 ULI1YFR026C 510 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 SAE3YHR079C-A 276 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 NCE101YJL205C 162 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 RPS27AYKL156W 249 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 MDM20YOL076W 2391 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 RPG1YBR079C 2895 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 RED1YLR263W 2484 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 EMP24YGL200C 612 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 PAU13YHL046C 363 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 ISA1YLL027W 753 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 SNC2YOR327C 348 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 ECM16YMR128W 3804 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 PUF6YDR496C 1971 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 CHL1YPL008W 2586 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 snR74snR74 88 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 YGL239CYGL239C 315 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 CWC22YGR278W 1734 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 SKG6YHR149C 2205 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 CDC27YBL084C 2277 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 PMP1YCR024C-A 123 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YPR053CYPR053C 456 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 FRE8YLR047C 2061 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 SLP1YOR154W 1764 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 SEN1YLR430W 6696 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YIL165CYIL165C 360 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RPB10YOR210W 213 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YPK9YOR291W 4419 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 GUP1YGL084C 1683 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 BBC1YJL020C 3474 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 SRP72YPL210C 1923 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RIA1YNL163C 3333 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 snR79snR79 84 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 GEP4YHR100C 558 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YJL022WYJL022W 309 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YPR146CYPR146C 330 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RSC3YDR303C 2658 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 NAM2YLR382C 2685 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 VIP1YLR410W 3441 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 JJJ2YJL162C 1752 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 PDC2YDR081C 2778 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 PIG1YLR273C 1947 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 CDC24YAL041W 2565 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RPL33BYOR234C 324 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YBR099CYBR099C 384 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 SSQ1YLR369W 1974 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 NUP82YJL061W 2142 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RPL38YLR325C 237 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 SEA4YBL104C 3117 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 SSS1YDR086C 243 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RPL6AYML073C 531 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 YOL057WYOL057W 2136 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 ARK1YNL020C 1917 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 RBK1YCR036W 1002 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 BRP1YGL007W 378 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 PDS5YMR076C 3834 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 NOP53YPL146C 1368 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 PTA1YAL043C 2358 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-BLQ12266 TCP1YDR212W 1680 nt3.84□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 MUK1YPL070W 1839 nt3.84□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 GDH2YDL215C 3279 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YPK1YKL126W 2043 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 VPS54YDR027C 2670 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 ERP6YGL002W 651 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YIL059CYIL059C 366 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YRM1YOR172W 2361 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 CWH43YCR017C 2862 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 OSH2YDL019C 3852 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 RPL23AYBL087C 414 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 APC2YLR127C 2562 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 FAA2YER015W 2235 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 GIP4YAL031C 2283 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YDR286CYDR286C 345 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 GIS2YNL255C 462 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 LYS2YBR115C 4179 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 FLO8YER109C 2400 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 MPS1YDL028C 2295 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 IPT1YDR072C 1584 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 RTC1YOL138C 4026 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 HOS3YPL116W 2094 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 HMG1YML075C 3165 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 TRZ1YKR079C 2517 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 ROD1YOR018W 2514 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 SAF1YBR280C 1914 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 IOC3YFR013W 2364 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 RPS18AYDR450W 441 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 SPB1YCL054W 2526 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 MIS1YBR084W 2928 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 NCL1YBL024W 2055 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 MNN4YKL201C 3537 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 VID28YIL017C 2766 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 ASC1YMR116C 960 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 IMH1YLR309C 2736 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 YDR341CYDR341C 1824 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 ISM1YPL040C 3009 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.78□□□□□ -1.8
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.78□□□□□ -1.8
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