Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 VPS8YAL002W 3825 nt2.13□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 MNE1YOR350C 1992 nt2.13□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YGL042CYGL042C 306 nt2.13□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 SSD1YDR293C 3753 nt2.13□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 TFC3YAL001C 3483 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 SMC6YLR383W 3345 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YDR199WYDR199W 366 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 CAJ1YER048C 1176 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YHR054CYHR054C 1065 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YLR302CYLR302C 363 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YNL235CYNL235C 432 nt2.12□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 PDR3YBL005W 2931 nt2.11□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 BRO1YPL084W 2535 nt2.11□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.11□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YPS5YGL259W 498 nt2.11□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 MND1YGL183C 660 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 DFG10YIL049W 762 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 AYR1YIL124W 894 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 SNC1YAL030W 354 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 ERG29YMR134W 714 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 DGR1YNL130C-A 147 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 ATP20YPR020W 348 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 HER1YOR227W 3741 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 CAT2YML042W 2013 nt2.1□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 LHS1YKL073W 2646 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 SKP2YNL311C 2292 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YDR018CYDR018C 1191 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 RPL40AYIL148W 387 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 URA5YML106W 681 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 LSM2YBL026W 288 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YNL319WYNL319W 441 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 TAZ1YPR140W 1146 nt2.09□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 PUT3YKL015W 2940 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 APM3YBR288C 1452 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 CRM1YGR218W 3255 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 PDR8YLR266C 2106 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SPC72YAL047C 1869 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YDL163WYDL163W 303 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 TPM2YIL138C 486 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 ECM9YKR004C 1134 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 TMA7YLR262C-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 ATP18YML081C-A 180 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YPL080CYPL080C 327 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 MED8YBR193C 672 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 snR43snR43 209 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 GAL80YML051W 1308 nt2.08□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 CRD1YDL142C 852 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 COX13YGL191W 390 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YKR051WYKR051W 1257 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YNL010WYNL010W 726 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 LSM7YNL147W 348 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YOR105WYOR105W 327 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SPE1YKL184W 1401 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 RRI2YOL117W 1938 nt2.07□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 MGA2YIR033W 3342 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 snR5snR5 204 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 snR70snR70 164 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SEC31YDL195W 3822 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 TEN1YLR010C 483 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YLR053CYLR053C 327 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 ARV1YLR242C 966 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 DGK1YOR311C 873 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 RPB5YBR154C 648 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SWR1YDR334W 4545 nt2.06□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 TDA9YML081W 3756 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YDL118WYDL118W 381 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YDR286CYDR286C 345 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 RPA34YJL148W 702 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 NBP1YLR457C 960 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YML084WYML084W 309 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 UFD4YKL010C 4452 nt2.05□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 MZM1YDR493W 372 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 IRC4YDR540C 540 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YFR016CYFR016C 3702 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 NOP10YHR072W-A 177 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 BET4YJL031C 984 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YJL147CYJL147C 1149 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 CSE4YKL049C 690 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 PSY1YKL076C 384 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SAP190YKR028W 3102 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YOL029CYOL029C 606 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 CSM4YPL200W 471 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SYH1YPL105C 2550 nt2.04□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SOK2YMR016C 2358 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 RPL37BYDR500C 267 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SMD1YGR074W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 RNR4YGR180C 1038 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 YGR228WYGR228W 345 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 PEP8YJL053W 1140 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 CCW14YLR390W-A 717 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 NAM7YMR080C 2916 nt2.03□□□□□ -2.08
NFI1Q12216 SSY1YDR160W 2559 nt2.03□□□□□ -2.09
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