Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 BST1YFL025C 3090 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 GTR2YGR163W 1026 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YMR144WYMR144W 1029 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 VTI1YMR197C 654 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 SPC42YKL042W 1092 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 CCL1YPR025C 1182 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 STB4YMR019W 2850 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 PBP4YDL053C 558 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 MRPL25YGR076C 474 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 NOP15YNL110C 663 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 ALY2YJL084C 3141 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 MED8YBR193C 672 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 EST2YLR318W 2655 nt0.9□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 LST4YKL176C 2487 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 AVT5YBL089W 1380 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YDL062WYDL062W 426 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 MSS2YDL107W 1056 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 RSA3YLR221C 663 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 NUP145YGL092W 3954 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 FMN1YDR236C 657 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 DAL5YJR152W 1632 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 IFH1YLR223C 3258 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 RTG3YBL103C 1461 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 MSS4YDR208W 2340 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 snR76snR76 109 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 RPA12YJR063W 378 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 HHT2YNL031C 411 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 PIN3YPR154W 648 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 AEP3YPL005W 1821 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 APC2YLR127C 2562 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 GLC7YER133W 939 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 POL4YCR014C 1749 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 HSE1YHL002W 1359 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 RPL37BYDR500C 267 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 CTK3YML112W 891 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 BEM3YPL115C 3387 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 SWI6YLR182W 2412 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 RRP6YOR001W 2202 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YDR018CYDR018C 1191 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 UBC5YDR059C 447 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YMR31YFR049W 372 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YJL169WYJL169W 369 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 DYN3YMR299C 939 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 PEX27YOR193W 1131 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YRO2YBR054W 1035 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 SNC1YAL030W 354 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 PRK1YIL095W 2433 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 PUF4YGL014W 2667 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 RNH202YDR279W 1053 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YGR190CYGR190C 366 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 FCF2YLR051C 654 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YLR400WYLR400W 474 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 BAG7YOR134W 1230 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 UBP11YKR098C 2154 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 YLR379WYLR379W 375 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 ATG5YPL149W 885 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-BRQ12193 PUS9YDL036C 1389 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 FUS1YCL027W 1539 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 UBC9YDL064W 474 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YLR444CYLR444C 303 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YOR203WYOR203W 354 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 CLG1YGL215W 1359 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YLR149CYLR149C 2193 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 ACA1YER045C 1470 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 CKA1YIL035C 1119 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YBL077WYBL077W 432 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 NME1NME1 340 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 SEC1YDR164C 2175 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YNR066CYNR066C 1311 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 ACB1YGR037C 264 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YDL026WYDL026W 312 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YGR064WYGR064W 369 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 PPN1YDR452W 2025 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 BTT1YDR252W 450 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 RMD5YDR255C 1266 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 SHR3YDL212W 633 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 LRS4YDR439W 1044 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 NBL1YHR199C-A 222 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 RGI2YIL057C 495 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 VOA1YGR106C 798 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 CTL1YMR180C 963 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 MPD1YOR288C 957 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-BRQ12193 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 HMI1YOL095C 2121 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 SEC63YOR254C 1992 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 APC5YOR249C 2058 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 HLR1YDR528W 1272 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 RPS18BYML026C 441 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 CUP9YPL177C 921 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BRQ12193 CLB5YPR120C 1308 nt0.77□□□□□ -2.29
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