Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 CLN3YAL040C 1743 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 UBC5YDR059C 447 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 RAD6YGL058W 519 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 AYR1YIL124W 894 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 ARV1YLR242C 966 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YLR252WYLR252W 306 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YOR283WYOR283W 693 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 VMA9YCL005W-A 222 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SNX41YDR425W 1878 nt2.34□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 NDD1YOR372C 1665 nt2.34□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 INO80YGL150C 4470 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 BI4Q0120 1917 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YDR199WYDR199W 366 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 RPS24AYER074W 408 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YGL015CYGL015C 393 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YIL058WYIL058W 285 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 UTP30YKR060W 825 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 DGK1YOR311C 873 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YPR096CYPR096C 303 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 SIR4YDR227W 4077 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 PES4YFR023W 1836 nt2.33□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 TFC3YAL001C 3483 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YGL165CYGL165C 579 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YIL029CYIL029C 429 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 IST3YIR005W 447 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 HYR1YIR037W 492 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 PEX17YNL214W 600 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 MEI5YPL121C 669 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 SNU114YKL173W 3027 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 GIS1YDR096W 2685 nt2.32□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 TOF1YNL273W 3717 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YOL098CYOL098C 3114 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YDL016CYDL016C 303 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 CMS1YLR003C 876 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YLR271WYLR271W 825 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YLR458WYLR458W 381 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 IGO1YNL157W 507 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YPL080CYPL080C 327 nt2.31□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 EMC4YGL231C 573 nt2.3□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 PEX4YGR133W 552 nt2.3□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 ATP7YKL016C 525 nt2.3□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 MGR1YCL044C 1254 nt2.3□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 snR84snR84 550 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YDR029WYDR029W 315 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 GCN4YEL009C 846 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YFR056CYFR056C 369 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 TPM2YIL138C 486 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 RPL40AYIL148W 387 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 PEP8YJL053W 1140 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 RAM2YKL019W 951 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 AFB1YLR040C 675 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 RPB11YOL005C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 ARF3YOR094W 552 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 TRS20YBR254C 528 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YBR277CYBR277C 402 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 NUP170YBL079W 4509 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 DPB11YJL090C 2295 nt2.29□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 AFI1YOR129C 2682 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 SPR3YGR059W 1539 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 TIM10YHR005C-A 282 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YJR141WYJR141W 1044 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 PAU8YAL068C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 RLP24YLR009W 600 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 BER1YLR412W 825 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 PAU20YOL161C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 RBL2YOR265W 321 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 UTP22YGR090W 3714 nt2.28□□□□□ -2.04
VPS54Q12071 ALK2YBL009W 2031 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 BRO1YPL084W 2535 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RNR4YGR180C 1038 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SPO13YHR014W 876 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 STE18YJR086W 333 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 ICY1YMR195W 384 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 DNF1YER166W 4716 nt2.27□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 MDM32YOR147W 1869 nt2.26□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.26□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 BUD19YJL188C 309 nt2.26□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 ILM1YJR118C 612 nt2.26□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RCN2YOR220W 798 nt2.26□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YJL181WYJL181W 1836 nt2.26□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RGA1YOR127W 3024 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 NAN1YPL126W 2691 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 PTC5YOR090C 1719 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 UBP11YKR098C 2154 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 FMP16YDR070C 282 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 BRP1YGL007W 378 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SHE2YKL130C 741 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 LCL2YLR104W 396 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RPS22BYLR367W 393 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 ATX2YOR079C 942 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YOR105WYOR105W 327 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 MCD1YDL003W 1701 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 BNI1YNL271C 5862 nt2.25□□□□□ -2.05
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