Protein–RNA interactions for Protein: P58545

Btbd3, BTB/POZ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd3P58545 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Btbd3P58545 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms