Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APJ1P53940 UTP30YKR060W 825 nt2.18□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YLR269CYLR269C 351 nt2.18□□□□□ -2.06
APJ1P53940 NSL1YPL233W 651 nt2.18□□□□□ -2.06
APJ1P53940 DPB3YBR278W 606 nt2.18□□□□□ -2.06
APJ1P53940 SHE4YOR035C 2370 nt2.18□□□□□ -2.06
APJ1P53940 IKI3YLR384C 4050 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 NMA111YNL123W 2994 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 RSE1YML049C 4086 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 IRA2YOL081W 9240 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YCR090CYCR090C 549 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 FMN1YDR236C 657 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 CPR5YDR304C 678 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YDR537CYDR537C 606 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YGR035CYGR035C 351 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 PEX4YGR133W 552 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 TCD1YHR003C 1290 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 ARV1YLR242C 966 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 COX8YLR395C 237 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YLR434CYLR434C 384 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 CDC33YOL139C 642 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 ATP22YDR350C 2055 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 RIM13YMR154C 2184 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YOL098CYOL098C 3114 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 DNL4YOR005C 2835 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 SPE1YKL184W 1401 nt2.17□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YBR259WYBR259W 2067 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 PDR1YGL013C 3207 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 MSH4YFL003C 2637 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 SMY2YBR172C 2223 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YEL057CYEL057C 702 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YIL054WYIL054W 318 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YBR032WYBR032W 303 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 IRC16YPR038W 360 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 TOP2YNL088W 4287 nt2.16□□□□□ -2.06
APJ1P53940 YHR078WYHR078W 1659 nt2.15□□□□□ -2.06
APJ1P53940 RRI2YOL117W 1938 nt2.15□□□□□ -2.06
APJ1P53940 snR65snR65 100 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YDR413CYDR413C 576 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YER097WYER097W 330 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 PCL5YHR071W 690 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 NBL1YHR199C-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 TMA10YLR327C 261 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 AIM32YML050W 936 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 RPS16AYMR143W 432 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 NOP15YNL110C 663 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SRL1YOR247W 633 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YOR277CYOR277C 309 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 ATP3YBR039W 936 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 LTP1YPR073C 486 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 MBA1YBR185C 837 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YBR209WYBR209W 318 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YKU80YMR106C 1890 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SLK19YOR195W 2466 nt2.15□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SIR3YLR442C 2937 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YGR025WYGR025W 303 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 PKR1YMR123W 369 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YOL114CYOL114C 609 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 RPC40YPR110C 1008 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 PIS1YPR113W 663 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 ARR2YPR200C 393 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SHS1YDL225W 1656 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 STN1YDR082W 1485 nt2.14□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YEF3YLR249W 3135 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SSF1YHR066W 1362 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YDR186CYDR186C 2634 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 snR68snR68 136 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 IRC2YDR112W 309 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YAR029WYAR029W 225 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 ATX1YNL259C 222 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YNL337WYNL337W 255 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YOR055WYOR055W 435 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 OST2YOR103C 393 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SAK1YER129W 3429 nt2.13□□□□□ -2.07
APJ1P53940 PHO2YDL106C 1680 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SWT1YOR166C 1377 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 ORC2YBR060C 1863 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 POL4YCR014C 1749 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 MDM36YPR083W 1740 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 BFR1YOR198C 1413 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 SDH7YDR511W 402 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YJL086CYJL086C 369 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 RPA12YJR063W 378 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 YOR121CYOR121C 306 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 snR43snR43 209 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 BI4Q0120 1917 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 BOI1YBL085W 2943 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 NEW1YPL226W 3591 nt2.12□□□□□ -2.07
APJ1P53940 PEX5YDR244W 1839 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.3 ms