Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 BNA7YDR428C 786 nt0.62□□□□□ -2.31
SSK2P53599 ATP16YDL004W 483 nt0.61□□□□□ -2.31
SSK2P53599 VMA5YKL080W 1179 nt0.61□□□□□ -2.31
SSK2P53599 HAL1YPR005C 885 nt0.61□□□□□ -2.31
SSK2P53599 SEC59YMR013C 1560 nt0.6□□□□□ -2.31
SSK2P53599 PBP4YDL053C 558 nt0.6□□□□□ -2.31
SSK2P53599 PCL9YDL179W 915 nt0.6□□□□□ -2.31
SSK2P53599 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt0.6□□□□□ -2.31
SSK2P53599 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.6□□□□□ -2.31
SSK2P53599 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.59□□□□□ -2.31
SSK2P53599 YGL177WYGL177W 348 nt0.59□□□□□ -2.31
SSK2P53599 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.58□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YDR018CYDR018C 1191 nt0.58□□□□□ -2.32
SSK2P53599 CIC1YHR052W 1131 nt0.58□□□□□ -2.32
SSK2P53599 SLY1YDR189W 2001 nt0.58□□□□□ -2.32
SSK2P53599 MFB1YDR219C 1398 nt0.58□□□□□ -2.32
SSK2P53599 PIN4YBL051C 2007 nt0.58□□□□□ -2.32
SSK2P53599 MRPL49YJL096W 486 nt0.57□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YNL034WYNL034W 1839 nt0.57□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YGR039WYGR039W 312 nt0.57□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.57□□□□□ -2.32
SSK2P53599 STE24YJR117W 1362 nt0.56□□□□□ -2.32
SSK2P53599 ESA1YOR244W 1338 nt0.56□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YNL179CYNL179C 438 nt0.56□□□□□ -2.32
SSK2P53599 CUR1YPR158W 759 nt0.56□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YDL183CYDL183C 963 nt0.55□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YDL026WYDL026W 312 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 NSE4YDL105W 1209 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 SNA4YDL123W 423 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 HUB1YNR032C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YBR096WYBR096W 693 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 SPP381YBR152W 876 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YDR132CYDR132C 1488 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 SAS3YBL052C 2496 nt0.54□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YMR147WYMR147W 672 nt0.53□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.53□□□□□ -2.32
SSK2P53599 PAF1YBR279W 1338 nt0.53□□□□□ -2.32
SSK2P53599 YAR075WYAR075W 474 nt0.53□□□□□ -2.33
SSK2P53599 RIM20YOR275C 1986 nt0.52□□□□□ -2.33
SSK2P53599 YOR062CYOR062C 807 nt0.52□□□□□ -2.33
SSK2P53599 CAF20YOR276W 486 nt0.52□□□□□ -2.33
SSK2P53599 RPL37BYDR500C 267 nt0.51□□□□□ -2.33
SSK2P53599 UFE1YOR075W 1041 nt0.51□□□□□ -2.33
SSK2P53599 CDC5YMR001C 2118 nt0.51□□□□□ -2.33
SSK2P53599 ENV11YGR071C 2583 nt0.51□□□□□ -2.33
SSK2P53599 LYS14YDR034C 2373 nt0.5□□□□□ -2.33
SSK2P53599 RPC11YDR045C 333 nt0.5□□□□□ -2.33
SSK2P53599 YLR053CYLR053C 327 nt0.49□□□□□ -2.33
SSK2P53599 NUP120YKL057C 3114 nt0.49□□□□□ -2.33
SSK2P53599 PET130YJL023C 1044 nt0.49□□□□□ -2.33
SSK2P53599 AIM36YMR157C 768 nt0.49□□□□□ -2.33
SSK2P53599 RPL40AYIL148W 387 nt0.48□□□□□ -2.33
SSK2P53599 SNC2YOR327C 348 nt0.48□□□□□ -2.33
SSK2P53599 YLR149CYLR149C 2193 nt0.47□□□□□ -2.33
SSK2P53599 ABM1YJR108W 372 nt0.47□□□□□ -2.33
SSK2P53599 ATG38YLR211C 681 nt0.47□□□□□ -2.33
SSK2P53599 MUS81YDR386W 1899 nt0.47□□□□□ -2.33
SSK2P53599 HMI1YOL095C 2121 nt0.47□□□□□ -2.33
SSK2P53599 YDL050CYDL050C 372 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 UBC5YDR059C 447 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YAP3YHL009C 993 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YAR068WYAR068W 486 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 CUP9YPL177C 921 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 KAR9YPL269W 1935 nt0.46□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YIP1YGR172C 747 nt0.45□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YLR379WYLR379W 375 nt0.45□□□□□ -2.34
SSK2P53599 BPH1YCR032W 6504 nt0.44□□□□□ -2.34
SSK2P53599 ACB1YGR037C 264 nt0.44□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YGR190CYGR190C 366 nt0.44□□□□□ -2.34
SSK2P53599 RNP1YLL046C 750 nt0.44□□□□□ -2.34
SSK2P53599 RGI1YER067W 486 nt0.43□□□□□ -2.34
SSK2P53599 BTN2YGR142W 1233 nt0.43□□□□□ -2.34
SSK2P53599 SAY1YGR263C 1275 nt0.43□□□□□ -2.34
SSK2P53599 VPS71YML041C 843 nt0.43□□□□□ -2.34
SSK2P53599 MRP2YPR166C 348 nt0.43□□□□□ -2.34
SSK2P53599 RXT2YBR095C 1293 nt0.43□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YGR011WYGR011W 327 nt0.42□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YOL114CYOL114C 609 nt0.42□□□□□ -2.34
SSK2P53599 snR45snR45 172 nt0.42□□□□□ -2.34
SSK2P53599 NGG1YDR176W 2109 nt0.42□□□□□ -2.34
SSK2P53599 PEP3YLR148W 2757 nt0.42□□□□□ -2.34
SSK2P53599 PCL6YER059W 1263 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YIL012WYIL012W 342 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 HYR1YIR037W 492 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 DAL5YJR152W 1632 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 SFT1YKL006C-A 294 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YRO2YBR054W 1035 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 NIP100YPL174C 2607 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 ICS2YBR157C 768 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 PUS9YDL036C 1389 nt0.41□□□□□ -2.34
SSK2P53599 BTT1YDR252W 450 nt0.4□□□□□ -2.34
SSK2P53599 MTC7YEL033W 420 nt0.4□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.4□□□□□ -2.34
SSK2P53599 RED1YLR263W 2484 nt0.4□□□□□ -2.34
SSK2P53599 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt0.4□□□□□ -2.35
SSK2P53599 SEC22YLR268W 645 nt0.4□□□□□ -2.35
SSK2P53599 YPR063CYPR063C 423 nt0.4□□□□□ -2.35
SSK2P53599 GLG1YKR058W 1851 nt0.39□□□□□ -2.35
SSK2P53599 YDR248CYDR248C 582 nt0.38□□□□□ -2.35
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