Protein–RNA interactions for Protein: P53394

YPR003C, Putative sulfate transporter YPR003C, yeastyeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR003CP53394 AI2Q0055 2565 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 FUS1YCL027W 1539 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 NIC96YFR002W 2520 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 ROY1YMR258C 1662 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 ATP17YDR377W 306 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 SDH7YDR511W 402 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 SEC22YLR268W 645 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 ZEO1YOL109W 342 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YPL185WYPL185W 396 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 GIN4YDR507C 3429 nt2.74□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 NAB3YPL190C 2409 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 PNC1YGL037C 651 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 ERP4YOR016C 624 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 PEP12YOR036W 867 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 COG3YER157W 2406 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 INP52YNL106C 3552 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 RAX2YLR084C 3663 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 LEU3YLR451W 2661 nt2.73□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 CYR1YJL005W 6081 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YGR025WYGR025W 303 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 RPS20YHL015W 366 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 ESL1YIL151C 3357 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 URA10YMR271C 684 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YBL071CYBL071C 309 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 snR13snR13 124 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 YPL276WYPL276W 438 nt2.72□□□□□ -1.97
YPR003CP53394 VPS64YDR200C 1815 nt2.71□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YSW1YBR148W 1830 nt2.71□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 NOP19YGR251W 591 nt2.71□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YPR039WYPR039W 336 nt2.71□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RPO41YFL036W 4056 nt2.71□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 POM152YMR129W 4014 nt2.71□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RPS17BYDR447C 411 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YMR31YFR049W 372 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RPS24BYIL069C 408 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 GPI14YJR013W 1212 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YLR434CYLR434C 384 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YNL146WYNL146W 303 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 DBP7YKR024C 2229 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 MED1YPR070W 1701 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 GNT1YOR320C 1476 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 SPB1YCL054W 2526 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YER138CYER138C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YER160CYER160C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YJR027WYJR027W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YML039WYML039W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YML045WYML045W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YMR050CYMR050C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.7□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 SSY1YDR160W 2559 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 AYT1YLL063C 1425 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 SLN1YIL147C 3663 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 PUF6YDR496C 1971 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RPC10YHR143W-A 213 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 PRE8YML092C 753 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RPS7BYNL096C 573 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YSY6YBR162W-A 198 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 DNA2YHR164C 4569 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 BNA4YBL098W 1383 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 FRE2YKL220C 2136 nt2.69□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 SEN54YPL083C 1404 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 ECM29YHL030W 5607 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RSN1YMR266W 2862 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 ECM5YMR176W 4236 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YNL034WYNL034W 1839 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 MET5YJR137C 4329 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 PEP8YJL053W 1140 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 SWM2YNR004W 441 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 ESF2YNR054C 951 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 DIE2YGR227W 1578 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 NDD1YOR372C 1665 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 PSK1YAL017W 4071 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 SOK1YDR006C 2706 nt2.68□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 PDR1YGL013C 3207 nt2.67□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.67□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.67□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RNP1YLL046C 750 nt2.67□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.67□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 RLF2YPR018W 1821 nt2.67□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 PTP3YER075C 2787 nt2.66□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 APC2YLR127C 2562 nt2.66□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 TAF2YCR042C 4224 nt2.66□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.66□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YGR035CYGR035C 351 nt2.66□□□□□ -1.98
YPR003CP53394 YIL058WYIL058W 285 nt2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms