Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR11P40550 TRS65YGR166W 1683 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR11P40550 SNF5YBR289W 2718 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR11P40550 PBP4YDL053C 558 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR11P40550 TAN1YGL232W 870 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR11P40550 SUI2YJR007W 915 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR11P40550 CCL1YPR025C 1182 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR11P40550 NOP15YNL110C 663 nt1.09□□□□□ -2.23
PDR11P40550 SWI4YER111C 3282 nt1.09□□□□□ -2.23
PDR11P40550 BUL2YML111W 2763 nt1.09□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YDR124WYDR124W 975 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YER107W-AYER107W-A 321 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YGR190CYGR190C 366 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 CMC4YMR194C-B 222 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 PFK27YOL136C 1194 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 FMP27YLR454W 7887 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 EAF1YDR359C 2949 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 ARK1YNL020C 1917 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 PRK1YIL095W 2433 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR11P40550 GLC7YER133W 939 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YGL138CYGL138C 1038 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 URA10YMR271C 684 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 TOA1YOR194C 861 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 FUS1YCL027W 1539 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YJL113WYJL113W 4647 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR11P40550 BAG7YOR134W 1230 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YOR203WYOR203W 354 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 IQG1YPL242C 4488 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 BTT1YDR252W 450 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 RPA12YJR063W 378 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YLR290CYLR290C 834 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 DPB3YBR278W 606 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR11P40550 THO2YNL139C 4794 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 MNE1YOR350C 1992 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 ECM11YDR446W 909 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 DSE2YHR143W 978 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 URM1YIL008W 300 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 NGL1YOL042W 1092 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR11P40550 RAD9YDR217C 3930 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YLR444CYLR444C 303 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YNL114CYNL114C 372 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR11P40550 snR191snR191 274 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR11P40550 PAF1YBR279W 1338 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 BST1YFL025C 3090 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 RRG1YDR065W 1098 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YEA4YEL004W 1029 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YGR114CYGR114C 390 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR11P40550 MSS11YMR164C 2277 nt1.02□□□□□ -2.25
PDR11P40550 MUB1YMR100W 1863 nt1.02□□□□□ -2.25
PDR11P40550 ATG38YLR211C 681 nt1.02□□□□□ -2.25
PDR11P40550 SRL1YOR247W 633 nt1.02□□□□□ -2.25
PDR11P40550 MNL2YLR057W 2550 nt1.02□□□□□ -2.25
PDR11P40550 YCR108CYCR108C 192 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR11P40550 ATP16YDL004W 483 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR11P40550 RRT15YLR162W-A 189 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR11P40550 RXT2YBR095C 1293 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR11P40550 SET3YKR029C 2256 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR11P40550 SEC63YOR254C 1992 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR11P40550 ATG10YLL042C 504 nt1□□□□□ -2.25
PDR11P40550 TEN1YLR010C 483 nt1□□□□□ -2.25
PDR11P40550 GIM3YNL153C 390 nt1□□□□□ -2.25
PDR11P40550 LTO1YNL260C 597 nt1□□□□□ -2.25
PDR11P40550 MGE1YOR232W 687 nt0.99□□□□□ -2.25
PDR11P40550 BUD3YCL014W 4911 nt0.99□□□□□ -2.25
PDR11P40550 APL1YJR005W 2103 nt0.99□□□□□ -2.25
PDR11P40550 LST4YKL176C 2487 nt0.99□□□□□ -2.25
PDR11P40550 YDL026WYDL026W 312 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 COBQ0105 1158 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 MRP49YKL167C 414 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 YIM2YMR151W 438 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 CTL1YMR180C 963 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 CDC39YCR093W 6327 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 SPO77YLR341W 1434 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 SPO12YHR152W 522 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 SRN2YLR119W 642 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 RPS10AYOR293W 318 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR11P40550 MLH3YPL164C 2148 nt0.97□□□□□ -2.25
PDR11P40550 AI1Q0050 2505 nt0.97□□□□□ -2.25
PDR11P40550 YOR218CYOR218C 420 nt0.97□□□□□ -2.25
PDR11P40550 MLP2YIL149C 5040 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR11P40550 WHI3YNL197C 1986 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR11P40550 REX3YLR107W 1215 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YLR169WYLR169W 354 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR11P40550 APL3YBL037W 3078 nt0.96□□□□□ -2.26
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