Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YKL111CYKL111C 336 nt3.08□□□□□ -1.92
VID28P40547 URA10YMR271C 684 nt3.08□□□□□ -1.92
VID28P40547 ZEO1YOL109W 342 nt3.08□□□□□ -1.92
VID28P40547 snR13snR13 124 nt3.08□□□□□ -1.92
VID28P40547 YOL057WYOL057W 2136 nt3.08□□□□□ -1.92
VID28P40547 DYN1YKR054C 12279 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 BPT1YLL015W 4680 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 NFT1YKR103W 3657 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 ATP17YDR377W 306 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 NOP19YGR251W 591 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 PEP8YJL053W 1140 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 HIT1YJR055W 495 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 YPL216WYPL216W 3309 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 RIF1YBR275C 5751 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 TFC1YBR123C 1950 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 NIC96YFR002W 2520 nt3.07□□□□□ -1.92
VID28P40547 AI2Q0055 2565 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 ECM29YHL030W 5607 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 SLH1YGR271W 5904 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 NAB6YML117W 3405 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 BUD4YJR092W 4344 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 SDH7YDR511W 402 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 YGR025WYGR025W 303 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 BUB1YGR188C 3066 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 FYV4YHR059W 393 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 APC2YLR127C 2562 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 LEU3YLR451W 2661 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 YPL185WYPL185W 396 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 YPL276WYPL276W 438 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 RLF2YPR018W 1821 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 SPB1YCL054W 2526 nt3.06□□□□□ -1.92
VID28P40547 YNL034WYNL034W 1839 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 MET5YJR137C 4329 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 YAT2YER024W 2772 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 PSK1YAL017W 4071 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 RPC10YHR143W-A 213 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 BAT1YHR208W 1182 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 ESF2YNR054C 951 nt3.05□□□□□ -1.92
VID28P40547 ECM5YMR176W 4236 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 RPL14BYHL001W 417 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 YPR039WYPR039W 336 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 YPR197CYPR197C 564 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 VPS64YDR200C 1815 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 YHR078WYHR078W 1659 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 NDD1YOR372C 1665 nt3.04□□□□□ -1.92
VID28P40547 DUF1YOL087C 3351 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 SSY1YDR160W 2559 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 HPA3YEL066W 540 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 YIL058WYIL058W 285 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 SWM2YNR004W 441 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 NAB3YPL190C 2409 nt3.03□□□□□ -1.92
VID28P40547 TRM2YKR056W 1920 nt3.02□□□□□ -1.93
VID28P40547 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.02□□□□□ -1.93
VID28P40547 RPS24BYIL069C 408 nt3.02□□□□□ -1.93
VID28P40547 YJR011CYJR011C 786 nt3.02□□□□□ -1.93
VID28P40547 DNA2YHR164C 4569 nt3.02□□□□□ -1.93
VID28P40547 GNT1YOR320C 1476 nt3.02□□□□□ -1.93
VID28P40547 YSW1YBR148W 1830 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 DSE4YNR067C 3354 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 TIM11YDR322C-A 291 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 YER189WYER189W 369 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 AIM32YML050W 936 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 RPS7BYNL096C 573 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 YIL166CYIL166C 1629 nt3.01□□□□□ -1.93
VID28P40547 PFF1YBR074W 2931 nt3□□□□□ -1.93
VID28P40547 snR70snR70 164 nt3□□□□□ -1.93
VID28P40547 ADK1YDR226W 669 nt3□□□□□ -1.93
VID28P40547 YML003WYML003W 873 nt3□□□□□ -1.93
VID28P40547 MRPL50YNR022C 420 nt3□□□□□ -1.93
VID28P40547 TCB2YNL087W 3537 nt3□□□□□ -1.93
VID28P40547 SOK1YDR006C 2706 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 NPR3YHL023C 3441 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 ECM25YJL201W 1800 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 TIM8YJR135W-A 264 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 SEC22YLR268W 645 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 YLR434CYLR434C 384 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 MKT1YNL085W 2493 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 DIE2YGR227W 1578 nt2.99□□□□□ -1.93
VID28P40547 IKI3YLR384C 4050 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 YEL057CYEL057C 702 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 CAJ1YER048C 1176 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 RPS20YHL015W 366 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 PET191YJR034W 327 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 GCD10YNL062C 1437 nt2.98□□□□□ -1.93
VID28P40547 TOM1YDR457W 9807 nt2.97□□□□□ -1.93
VID28P40547 SPC72YAL047C 1869 nt2.97□□□□□ -1.93
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