Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 RPL37AYLR185W 267 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 SMA2YML066C 1110 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 GCN1YGL195W 8019 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 MET10YFR030W 3108 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YCK3YER123W 1575 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 DBP10YDL031W 2988 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 CHS2YBR038W 2892 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YKL111CYKL111C 336 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 GOT1YMR292W 417 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 PEX11YOL147C 711 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 RPS7AYOR096W 573 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YSP2YDR326C 4317 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 ALY1YKR021W 2748 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YDL176WYDL176W 2127 nt2.78□□□□□ -1.96
XBP1P40489 CWH41YGL027C 2502 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 NOP4YPL043W 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 CDC36YDL165W 576 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPL23AYBL087C 414 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YOL160WYOL160W 342 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 EGD1YPL037C 474 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SEC15YGL233W 2733 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YDR089WYDR089W 2610 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 ATP25YMR098C 1839 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YMR317WYMR317W 3423 nt2.77□□□□□ -1.97
XBP1P40489 ARG2YJL071W 1725 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 ENA2YDR039C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 ENA1YDR040C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YDL242WYDL242W 354 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SRL3YKR091W 741 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 COA4YLR218C 453 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YLR458WYLR458W 381 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 ATP22YDR350C 2055 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 GIS4YML006C 2325 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 VTC4YJL012C 2166 nt2.76□□□□□ -1.97
XBP1P40489 CHO2YGR157W 2610 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 MPS1YDL028C 2295 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 PSY1YKL076C 384 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPS22BYLR367W 393 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YGR237CYGR237C 2358 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SPP382YLR424W 2127 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YHR078WYHR078W 1659 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RIF1YBR275C 5751 nt2.75□□□□□ -1.97
XBP1P40489 JJJ2YJL162C 1752 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SLP1YOR154W 1764 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RCY1YJL204C 2523 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SMT3YDR510W 306 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPS23AYGR118W 438 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPS23BYPR132W 438 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RKM1YPL208W 1752 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 MDM1YML104C 3384 nt2.74□□□□□ -1.97
XBP1P40489 PAC1YOR269W 1485 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YDR250CYDR250C 276 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 HPA3YEL066W 540 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPB9YGL070C 369 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 DLS1YJL065C 504 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 PFD1YJL179W 330 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 PHD1YKL043W 1101 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 TMA10YLR327C 261 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPL26AYLR344W 384 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RPS12YOR369C 432 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SPO14YKR031C 5052 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 SNF12YNR023W 1701 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RED1YLR263W 2484 nt2.73□□□□□ -1.97
XBP1P40489 UBP5YER144C 2418 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 PCF11YDR228C 1881 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 MUS81YDR386W 1899 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 ATP8Q0080 147 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 TIF35YDR429C 825 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YAT2YER024W 2772 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YJL182CYJL182C 318 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 TFC1YBR123C 1950 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 RGC1YPR115W 3252 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 VHR2YER064C 1518 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 IOC3YFR013W 2364 nt2.72□□□□□ -1.97
XBP1P40489 AIM11YER093C-A 414 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YGL149WYGL149W 306 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 APQ12YIL040W 417 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TIM8YJR135W-A 264 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TAR1YLR154W-C 375 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ISU1YPL135W 498 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YCL023CYCL023C 348 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TCP1YDR212W 1680 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YOR296WYOR296W 3870 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 COX1Q0045 1605 nt2.71□□□□□ -1.98
XBP1P40489 FLO1YAR050W 4614 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TLC1TLC1 1301 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 OSW7YFR039C 1533 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YDR344CYDR344C 444 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 WIP1YDR374W-A 270 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TSA2YDR453C 591 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ISD11YER048W-A 285 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 PAM16YJL104W 450 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 RPL8BYLL045C 771 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR416CYLR416C 399 nt2.7□□□□□ -1.98
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