Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 NPR1YNL183C 2373 nt5.31□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YEL045CYEL045C 426 nt5.3□□□□□ -1.56
SSP1P38871 POG1YIL122W 1056 nt5.3□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt5.3□□□□□ -1.56
SSP1P38871 FAP1YNL023C 2898 nt5.3□□□□□ -1.56
SSP1P38871 KIP3YGL216W 2418 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YGL074CYGL074C 327 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 TRX1YLR043C 312 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 SNC2YOR327C 348 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 CIN1YOR349W 3045 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 TRM2YKR056W 1920 nt5.29□□□□□ -1.56
SSP1P38871 CDC27YBL084C 2277 nt5.28□□□□□ -1.56
SSP1P38871 CHS3YBR023C 3498 nt5.28□□□□□ -1.56
SSP1P38871 YLR255CYLR255C 354 nt5.28□□□□□ -1.56
SSP1P38871 RPS23BYPR132W 438 nt5.28□□□□□ -1.56
SSP1P38871 PWP2YCR057C 2772 nt5.28□□□□□ -1.56
SSP1P38871 SWA2YDR320C 2007 nt5.27□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.27□□□□□ -1.57
SSP1P38871 NUP2YLR335W 2163 nt5.27□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YDR286CYDR286C 345 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 RPS17BYDR447C 411 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YER187WYER187W 426 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 RPL28YGL103W 450 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 COX23YHR116W 456 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YLR012CYLR012C 300 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt5.26□□□□□ -1.57
SSP1P38871 SKT5YBL061C 2091 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 RSC1YGR056W 2787 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 GRS1YBR121C 2004 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 ERP6YGL002W 651 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YPR014CYPR014C 330 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YGR125WYGR125W 3111 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 MSH1YHR120W 2880 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 SRP72YPL210C 1923 nt5.25□□□□□ -1.57
SSP1P38871 PEX1YKL197C 3132 nt5.24□□□□□ -1.57
SSP1P38871 DFG16YOR030W 1860 nt5.24□□□□□ -1.57
SSP1P38871 QCR7YDR529C 384 nt5.24□□□□□ -1.57
SSP1P38871 RPL20BYOR312C 519 nt5.24□□□□□ -1.57
SSP1P38871 SGF11YPL047W 300 nt5.24□□□□□ -1.57
SSP1P38871 YPR003CYPR003C 2265 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 SSS1YDR086C 243 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 TOM5YPR133W-A 153 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 DPH6YLR143W 2058 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 SED4YCR067C 3198 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 CDC15YAR019C 2925 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 OSH2YDL019C 3852 nt5.23□□□□□ -1.57
SSP1P38871 RSM19YNR037C 276 nt5.22□□□□□ -1.57
SSP1P38871 NSP1YJL041W 2472 nt5.22□□□□□ -1.57
SSP1P38871 CDC20YGL116W 1833 nt5.21□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YMR102CYMR102C 2505 nt5.21□□□□□ -1.58
SSP1P38871 ZDS1YMR273C 2748 nt5.21□□□□□ -1.58
SSP1P38871 VPS54YDR027C 2670 nt5.2□□□□□ -1.58
SSP1P38871 GPI13YLL031C 3054 nt5.2□□□□□ -1.58
SSP1P38871 KIC1YHR102W 3243 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 BCK2YER167W 2556 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 ROT2YBR229C 2865 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 SSB1YDL229W 1842 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 SSB2YNL209W 1842 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 APC11YDL008W 498 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YEL073CYEL073C 324 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 ULI1YFR026C 510 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 INA22YIR024C 651 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YMR324CYMR324C 243 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YCG1YDR325W 3108 nt5.19□□□□□ -1.58
SSP1P38871 PHO81YGR233C 3537 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP1P38871 snR72snR72 98 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YGL024WYGL024W 336 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP1P38871 MSR1YHR091C 1932 nt5.18□□□□□ -1.58
SSP1P38871 HMG1YML075C 3165 nt5.17□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YBR184WYBR184W 1572 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP1P38871 snR74snR74 88 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YOL057WYOL057W 2136 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP1P38871 TPS3YMR261C 3165 nt5.16□□□□□ -1.58
SSP1P38871 IOC2YLR095C 2439 nt5.15□□□□□ -1.58
SSP1P38871 YDR193WYDR193W 399 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP1P38871 AUA1YFL010W-A 285 nt5.15□□□□□ -1.59
SSP1P38871 NUP133YKR082W 3474 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 BNI4YNL233W 2679 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 MUK1YPL070W 1839 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 GIN4YDR507C 3429 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 NUP120YKL057C 3114 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 ECM15YBL001C 315 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 YJL206CYJL206C 2277 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 COG3YER157W 2406 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 MSH2YOL090W 2895 nt5.14□□□□□ -1.59
SSP1P38871 YGL069CYGL069C 465 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP1P38871 FPR1YNL135C 345 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP1P38871 snR17bsnR17b 332 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP1P38871 TIM12YBR091C 330 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP1P38871 SNU114YKL173W 3027 nt5.13□□□□□ -1.59
SSP1P38871 KAR3YPR141C 2190 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP1P38871 TIF4632YGL049C 2745 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP1P38871 CPA2YJR109C 3357 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP1P38871 TMN3YER113C 2121 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP1P38871 VHC1YBR235W 3363 nt5.12□□□□□ -1.59
SSP1P38871 CLF1YLR117C 2064 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP1P38871 PRE4YFR050C 801 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP1P38871 LSO2YGR169C-A 279 nt5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62 ms