Protein–RNA interactions for Protein: P27801

PEP3, Vacuolar membrane protein PEP3, yeastyeast

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEP3P27801 PRP6YBR055C 2700 nt2.59□□□□□ -2
PEP3P27801 SPF1YEL031W 3648 nt2.59□□□□□ -2
PEP3P27801 TFC3YAL001C 3483 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 YIL058WYIL058W 285 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 TPM2YIL138C 486 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 YOL134CYOL134C 390 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 SVS1YPL163C 783 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 NUP120YKL057C 3114 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 DPB11YJL090C 2295 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 MDM32YOR147W 1869 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 ECM5YMR176W 4236 nt2.58□□□□□ -2
PEP3P27801 SSE1YPL106C 2082 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 TOP2YNL088W 4287 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 NDD1YOR372C 1665 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 ASG1YIL130W 2895 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 YCR108CYCR108C 192 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 YKR051WYKR051W 1257 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 RPS1AYLR441C 768 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 ATP19YOL077W-A 207 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 YBL108WYBL108W 306 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 GAL7YBR018C 1101 nt2.57□□□□□ -2
PEP3P27801 SAK1YER129W 3429 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 AMS1YGL156W 3252 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 GPI8YDR331W 1236 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 YGR050CYGR050C 357 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 RNR4YGR180C 1038 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 PEP8YJL053W 1140 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 RPS29AYLR388W 171 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 YNL122CYNL122C 348 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 DGK1YOR311C 873 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 SNU56YDR240C 1479 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 NUP170YBL079W 4509 nt2.56□□□□□ -2
PEP3P27801 YPR089WYPR089W 2667 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 INP53YOR109W 3324 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 RPL9AYGL147C 576 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 PEX4YGR133W 552 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 HYR1YIR037W 492 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 YLR458WYLR458W 381 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 FAR11YNL127W 2862 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 PSK2YOL045W 3306 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 LEU3YLR451W 2661 nt2.55□□□□□ -2
PEP3P27801 SDC1YDR469W 528 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 YGR045CYGR045C 363 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 MRPL44YMR225C 297 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 PRK1YIL095W 2433 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 YBT1YLL048C 4986 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 DNF1YER166W 4716 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 SWR1YDR334W 4545 nt2.54□□□□□ -2
PEP3P27801 RTR2YDR066C 591 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 GCN4YEL009C 846 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 YGL165CYGL165C 579 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 ACB1YGR037C 264 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 RPL40AYIL148W 387 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 KTI11YBL071W-A 249 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
PEP3P27801 UTP22YGR090W 3714 nt2.53□□□□□ -2.01
PEP3P27801 SHE9YDR393W 1371 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 HYP2YEL034W 474 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 RPS24AYER074W 408 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 AYR1YIL124W 894 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 HSC82YMR186W 2118 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 URA10YMR271C 684 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 MGR1YCL044C 1254 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 ROY1YMR258C 1662 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 UTP13YLR222C 2454 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 SSD1YDR293C 3753 nt2.52□□□□□ -2.01
PEP3P27801 BRO1YPL084W 2535 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 RGL1YPL066W 1440 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 IRC4YDR540C 540 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 RAM2YKL019W 951 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YOR105WYOR105W 327 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 PET123YOR158W 957 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 KRE33YNL132W 3171 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 TRA1YHR099W 11235 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 KSP1YHR082C 3090 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 ALK2YBL009W 2031 nt2.51□□□□□ -2.01
PEP3P27801 SNX41YDR425W 1878 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YEL043WYEL043W 2871 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YDR220CYDR220C 294 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YAP3YHL009C 993 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 RPL16AYIL133C 600 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 FYV7YLR068W 456 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 LCL2YLR104W 396 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 HOS4YIL112W 3252 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
PEP3P27801 PES4YFR023W 1836 nt2.49□□□□□ -2.01
PEP3P27801 UFD4YKL010C 4452 nt2.49□□□□□ -2.01
PEP3P27801 VPS16YPL045W 2397 nt2.49□□□□□ -2.01
PEP3P27801 RPF1YHR088W 888 nt2.49□□□□□ -2.01
PEP3P27801 ATP7YKL016C 525 nt2.49□□□□□ -2.01
PEP3P27801 ICY1YMR195W 384 nt2.49□□□□□ -2.01
PEP3P27801 RPL25YOL127W 429 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.1 ms