Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brpf1B2RRD7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms