Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms