Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms