Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm5Q9D806 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm5Q9D806 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms