Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc4Q8BP86 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snapc4Q8BP86 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc4Q8BP86 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.6 ms