Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nup214Q80U93 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup214Q80U93 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms