Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms