Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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