Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 GON7YJL184W 372 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 RPL36AYMR194W 303 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 SRB4YER022W 2064 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 DPH6YLR143W 2058 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 SWI3YJL176C 2478 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 UBP12YJL197W 3765 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 CDC15YAR019C 2925 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 MRPL39YML009C 213 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 SWC3YAL011W 1878 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 MET4YNL103W 2019 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 OAF1YAL051W 3144 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 ALY1YKR021W 2748 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 MSS11YMR164C 2277 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 SAR1YPL218W 573 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 SEC5YDR166C 2916 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 TRM44YPL030W 1704 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 HDA3YPR179C 1968 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 MSR1YHR091C 1932 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 PEX5YDR244W 1839 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 CCW14YLR390W-A 717 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 RLM1YPL089C 2031 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 NNK1YKL171W 2787 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 EBS1YDR206W 2655 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 HUL4YJR036C 2679 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 EGT2YNL327W 3126 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BLQ12266 HFA1YMR207C 6372 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 KEX1YGL203C 2190 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 SNA2YDR525W-A 240 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 SRL3YKR091W 741 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 JHD2YJR119C 2187 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 CDC45YLR103C 1953 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 DAP2YHR028C 2457 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 ROK1YGL171W 1695 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 MNL1YHR204W 2391 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 NPC2YDL046W 522 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 RPS29BYDL061C 171 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 GOT1YMR292W 417 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 HHF1YBR009C 312 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 MGR2YPL098C 342 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YSH1YLR277C 2340 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 SAP4YGL229C 2457 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 SBE2YDR351W 2595 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 snR7-SsnR7-S 179 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 POG1YIL122W 1056 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 PDE2YOR360C 1581 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 KIC1YHR102W 3243 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YPL260WYPL260W 1656 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 GLN4YOR168W 2430 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 CYM1YDR430C 2970 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 snR61snR61 90 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YGR269WYGR269W 327 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 UPS1YLR193C 528 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 RDH54YBR073W 2877 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 PEP5YMR231W 3090 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 ISW2YOR304W 3363 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 VAC7YNL054W 3498 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 COA3YJL062W-A 258 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 SSY1YDR160W 2559 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YER077CYER077C 2067 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 AVT1YJR001W 1809 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 GRC3YLL035W 1899 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 PRM15YMR278W 1869 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 MNR2YKL064W 2910 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 ECM15YBL001C 315 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YNR042WYNR042W 429 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YPR092WYPR092W 306 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 CWH41YGL027C 2502 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 UPC2YDR213W 2742 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 OAF3YKR064W 2592 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 GYP7YDL234C 2241 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 ASG1YIL130W 2895 nt3.96□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 PMC1YGL006W 3522 nt3.96□□□□□ -1.77
TY1A-BLQ12266 YIL166CYIL166C 1629 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 YEL073CYEL073C 324 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 PHM7YOL084W 2976 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 SGF11YPL047W 300 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 KIP3YGL216W 2418 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 LCD1YDR499W 2244 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 HBT1YDL223C 3141 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 ALR2YFL050C 2577 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 LCB5YLR260W 2064 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 TSA2YDR453C 591 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 DLS1YJL065C 504 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 RPS18BYML026C 441 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 ISU1YPL135W 498 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 SPO21YOL091W 1830 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 TEL1YBL088C 8364 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 PFK1YGR240C 2964 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 AIM21YIR003W 2040 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 ARG5,6YER069W 2592 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 TFB1YDR311W 1929 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-BLQ12266 YDL041WYDL041W 354 nt3.93□□□□□ -1.78
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