Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 RGR1YLR071C 3249 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RNR4YGR180C 1038 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YKL136WYKL136W 399 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 ADI1YMR009W 540 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RPL20AYMR242C 519 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YNL179CYNL179C 438 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.84□□□□□ -1.95
UBX3Q12229 RSN1YMR266W 2862 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 BOI1YBL085W 2943 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 FRE2YKL220C 2136 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 TSC11YER093C 4293 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SDH7YDR511W 402 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SMB1YER029C 591 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RRT13YER066W 558 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 TWF1YGR080W 999 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YLR230WYLR230W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 MET6YER091C 2304 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 CBP2YHL038C 1893 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RPN1YHR027C 2982 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 FAR1YJL157C 2493 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SPO71YDR104C 3738 nt2.83□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YOR296WYOR296W 3870 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RPA190YOR341W 4995 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 UBC7YMR022W 498 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YBL065WYBL065W 345 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 ZEO1YOL109W 342 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 TFC4YGR047C 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 BFR1YOR198C 1413 nt2.82□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YEL1YBL060W 2064 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SRC1YML034W 2505 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 BAT1YHR208W 1182 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 PHD1YKL043W 1101 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 COQ10YOL008W 624 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.81□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 POL3YDL102W 3294 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RNH70YGR276C 1662 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YGL165CYGL165C 579 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YIL054WYIL054W 318 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 MRPL31YKL138C 396 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YPL142CYPL142C 318 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SEC7YDR170C 6030 nt2.8□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SSP1YHR184W 1716 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 UTP13YLR222C 2454 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YGR067CYGR067C 2415 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YCR022CYCR022C 345 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YGR035CYGR035C 351 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RPS24BYIL069C 408 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 ABM1YJR108W 372 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 UNG1YML021C 1080 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 HHT2YNL031C 411 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YAF9YNL107W 681 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 PBS2YJL128C 2007 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 BUD4YJR092W 4344 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 TFB1YDR311W 1929 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 DYN1YKR054C 12279 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 BIT61YJL058C 1632 nt2.79□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 ECM21YBL101C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 MSB2YGR014W 3921 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 FYV4YHR059W 393 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RPL8BYLL045C 771 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 PAU23YLR037C 375 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 LSM2YBL026W 288 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RPL23AYBL087C 414 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 OST2YOR103C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 RPL33AYPL143W 324 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YOL057WYOL057W 2136 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 SRB4YER022W 2064 nt2.78□□□□□ -1.96
UBX3Q12229 YDR366CYDR366C 399 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 PEP12YOR036W 867 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 TSC3YBR058C-A 243 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 RRM3YHR031C 2172 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 RIF1YBR275C 5751 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 JJJ2YJL162C 1752 nt2.77□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 RCY1YJL204C 2523 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 HPA3YEL066W 540 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 PEX17YNL214W 600 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 ERP4YOR016C 624 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 YOR121CYOR121C 306 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 GYP7YDL234C 2241 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 MOT1YPL082C 5604 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 ARK1YNL020C 1917 nt2.76□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 ESL1YIL151C 3357 nt2.75□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 SLH1YGR271W 5904 nt2.75□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 NHP2YDL208W 471 nt2.75□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 RPS26BYER131W 360 nt2.75□□□□□ -1.97
UBX3Q12229 ERP6YGL002W 651 nt2.75□□□□□ -1.97
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