Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 YIL165CYIL165C 360 nt4.64□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 CSE2YNR010W 450 nt4.64□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YGR250CYGR250C 2346 nt4.64□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YDR426CYDR426C 378 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YEL045CYEL045C 426 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 NKP2YLR315W 462 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 RPS18BYML026C 441 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YOR015WYOR015W 360 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YTA6YPL074W 2265 nt4.63□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 CHL1YPL008W 2586 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SRL3YKR091W 741 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 MRPL33YMR286W 261 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SSY1YDR160W 2559 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 PGM2YMR105C 1710 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 MSS11YMR164C 2277 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 GRC3YLL035W 1899 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 GPR1YDL035C 2886 nt4.62□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 LCB5YLR260W 2064 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SFI1YLL003W 2841 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 PFK26YIL107C 2484 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 PRM15YMR278W 1869 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 FRE8YLR047C 2061 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YSH1YLR277C 2340 nt4.61□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SEG2YKL105C 3399 nt4.6□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 snR72snR72 98 nt4.6□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 NPC2YDL046W 522 nt4.6□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt4.6□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt4.6□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 SLP1YOR154W 1764 nt4.6□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 BLM10YFL007W 6432 nt4.59□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 JJJ2YJL162C 1752 nt4.59□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YLR012CYLR012C 300 nt4.59□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 APC9YLR102C 798 nt4.59□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 YML037CYML037C 1023 nt4.59□□□□□ -1.67
YRR1Q12172 RTC1YOL138C 4026 nt4.59□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 NAT1YDL040C 2565 nt4.59□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 CDC45YLR103C 1953 nt4.58□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 IMH1YLR309C 2736 nt4.58□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 SAR1YPL218W 573 nt4.58□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 JHD2YJR119C 2187 nt4.58□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YDL041WYDL041W 354 nt4.57□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YGL239CYGL239C 315 nt4.57□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 NCE101YJL205C 162 nt4.57□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YPL278CYPL278C 303 nt4.57□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 NRP1YDL167C 2160 nt4.57□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YIL166CYIL166C 1629 nt4.57□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 DPH6YLR143W 2058 nt4.56□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 SEA4YBL104C 3117 nt4.56□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 RAD54YGL163C 2697 nt4.56□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 GYP7YDL234C 2241 nt4.56□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 PDC2YDR081C 2778 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 APC1YNL172W 5247 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 CDC24YAL041W 2565 nt4.55□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 FRT2YAL028W 1587 nt4.54□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 LYP1YNL268W 1836 nt4.54□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 SPI1YER150W 447 nt4.54□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 PDR5YOR153W 4536 nt4.54□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 LCD1YDR499W 2244 nt4.54□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 MDM20YOL076W 2391 nt4.54□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 UPC2YDR213W 2742 nt4.53□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 SEC5YDR166C 2916 nt4.53□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 PDE2YOR360C 1581 nt4.53□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 RAD16YBR114W 2373 nt4.53□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 DLS1YJL065C 504 nt4.53□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 OM14YBR230C 405 nt4.53□□□□□ -1.68
YRR1Q12172 YBR184WYBR184W 1572 nt4.53□□□□□ -1.69
YRR1Q12172 YGR125WYGR125W 3111 nt4.52□□□□□ -1.69
YRR1Q12172 NUP85YJR042W 2235 nt4.52□□□□□ -1.69
YRR1Q12172 AIM21YIR003W 2040 nt4.52□□□□□ -1.69
YRR1Q12172 SBH1YER087C-B 249 nt4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103.3 ms