Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 AAD16YFL057C 459 nt2.45□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YGR050CYGR050C 357 nt2.45□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YNL046WYNL046W 519 nt2.45□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 ATP3YBR039W 936 nt2.45□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 NSL1YPL233W 651 nt2.45□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YNL018CYNL018C 1839 nt2.45□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YDR018CYDR018C 1191 nt2.44□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 GET1YGL020C 708 nt2.44□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 COG2YGR120C 789 nt2.44□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 ATG38YLR211C 681 nt2.44□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 APL5YPL195W 2799 nt2.44□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 ECM25YJL201W 1800 nt2.44□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 MRP10YDL045W-A 288 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YDL187CYDL187C 330 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 PEA2YER149C 1263 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 MPO1YGL010W 525 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 SCEIQ0160 708 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 HOS4YIL112W 3252 nt2.43□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 STD1YOR047C 1335 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 ROY1YMR258C 1662 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 AIM32YML050W 936 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 HHT2YNL031C 411 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 RPL25YOL127W 429 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YPL034WYPL034W 498 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 PRP6YBR055C 2700 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 PSK2YOL045W 3306 nt2.42□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YNL034WYNL034W 1839 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YCR108CYCR108C 192 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YFH1YDL120W 525 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YRB1YDR002W 606 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 CHZ1YER030W 462 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 RPL29YFR032C-A 180 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 TRM7YBR061C 933 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 SCD5YOR329C 2619 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 SVL3YPL032C 2478 nt2.41□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 INP53YOR109W 3324 nt2.4□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 VPS13YLL040C 9435 nt2.4□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 CSF1YLR087C 8877 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 TSA2YDR453C 591 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SLX9YGR081C 633 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 LAG1YHL003C 1236 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 BET3YKR068C 582 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 HRI1YLR301W 735 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 ERG29YMR134W 714 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 HSC82YMR186W 2118 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YPR153WYPR153W 423 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YBR197CYBR197C 654 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YPR089WYPR089W 2667 nt2.4□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 AFR1YDR085C 1863 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 RRI2YOL117W 1938 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SDC1YDR469W 528 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 VTC1YER072W 390 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 ACB1YGR037C 264 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 DFG10YIL049W 762 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 BET4YJL031C 984 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YLR302CYLR302C 363 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YNL303WYNL303W 348 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SWM2YNR004W 441 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 DAD3YBR233W-A 285 nt2.39□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 CBF2YGR140W 2871 nt2.38□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 PET191YJR034W 327 nt2.38□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SAS2YMR127C 1017 nt2.38□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 RGL1YPL066W 1440 nt2.38□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YPR097WYPR097W 3222 nt2.38□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 IRA2YOL081W 9240 nt2.38□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 TIM9YEL020W-A 264 nt2.37□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 GMC2YLR445W 567 nt2.37□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.37□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.37□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SSE1YPL106C 2082 nt2.37□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 TUS1YLR425W 3924 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YEL043WYEL043W 2871 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 KSP1YHR082C 3090 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 ECM5YMR176W 4236 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YPK1YKL126W 2043 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 PRS3YHL011C 963 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YJR023CYJR023C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YHC1YLR298C 696 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YMR320WYMR320W 306 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SWS2YNL081C 432 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 PRK1YIL095W 2433 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SSF2YDR312W 1362 nt2.36□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 ASG1YIL130W 2895 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 NUP100YKL068W 2880 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 MMS22YLR320W 4365 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 VPS16YPL045W 2397 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SAP190YKR028W 3102 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 GPI8YDR331W 1236 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 TWF1YGR080W 999 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 YIR020CYIR020C 303 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 VPS51YKR020W 495 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 LSM2YBL026W 288 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 SSF1YHR066W 1362 nt2.35□□□□□ -2.03
VPS54Q12071 LEU3YLR451W 2661 nt2.35□□□□□ -2.03
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