Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col10a1Q05306 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col10a1Q05306 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms