Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psme1P97371 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms