Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 ALG8YOR067C 1734 nt2.88□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YHR080CYHR080C 4038 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YAK1YJL141C 2424 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 SET1YHR119W 3243 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RMT2YDR465C 1239 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 CYC7YEL039C 342 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 PRE8YML092C 753 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 TIM12YBR091C 330 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 snR42snR42 351 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 SLM6YBR266C 453 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 CBP2YHL038C 1893 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 SKP2YNL311C 2292 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YKL222CYKL222C 2118 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 BAR1YIL015W 1764 nt2.87□□□□□ -1.95
XBP1P40489 NDD1YOR372C 1665 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 STE23YLR389C 3084 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 snR80snR80 171 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 NOP19YGR251W 591 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YGR265WYGR265W 411 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YIR040CYIR040C 333 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RPS21BYJL136C 264 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RPL15AYLR029C 615 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 PGA1YNL158W 597 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 HCH1YNL281W 462 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RPB11YOL005C 363 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YPR099CYPR099C 357 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 PFK26YIL107C 2484 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 SIZ1YDR409W 2715 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 MSH4YFL003C 2637 nt2.86□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RAD5YLR032W 3510 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 STT4YLR305C 5703 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YBP1YBR216C 2025 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 TOP1YOL006C 2310 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 PSF1YDR013W 627 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RPL29YFR032C-A 180 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 LYS9YNR050C 1341 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 POL3YDL102W 3294 nt2.85□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YKL100CYKL100C 1764 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 RPA135YPR010C 3612 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YFR056CYFR056C 369 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 USE1YGL098W 738 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 NOT5YPR072W 1683 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 FAS1YKL182W 6156 nt2.84□□□□□ -1.95
XBP1P40489 DNM1YLL001W 2274 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 ERG28YER044C 447 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 HMF1YER057C 390 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 RPL30YGL030W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 RPC10YHR143W-A 213 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 HBT1YDL223C 3141 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 SRB4YER022W 2064 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 KIN82YCR091W 2163 nt2.83□□□□□ -1.96
XBP1P40489 PDS5YMR076C 3834 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 REC8YPR007C 2043 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 RAD6YGL058W 519 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YGR069WYGR069W 336 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 BAT1YHR208W 1182 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 PAU14YIL176C 363 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 PAU1YJL223C 363 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 PAU23YLR037C 375 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YBL073WYBL073W 312 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 MDM32YOR147W 1869 nt2.82□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YLR012CYLR012C 300 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 RPS28BYLR264W 204 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 IRC23YOR044W 474 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YPL229WYPL229W 621 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 MES1YGR264C 2256 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 DPB11YJL090C 2295 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 CCM1YGR150C 2595 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YTA7YGR270W 4140 nt2.81□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YLR001CYLR001C 2589 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 NTO1YPR031W 2247 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 FRE8YLR047C 2061 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YSW1YBR148W 1830 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 IRC10YOL015W 1761 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 FRQ1YDR373W 573 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 MBB1YJL199C 327 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 RPL9BYNL067W 576 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 snR51snR51 107 nt2.8□□□□□ -1.96
XBP1P40489 SNX41YDR425W 1878 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 IRC4YDR540C 540 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 AST2YER101C 1293 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 URM1YIL008W 300 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 HYR1YIR037W 492 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YJR023CYJR023C 402 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.79□□□□□ -1.96
XBP1P40489 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.79□□□□□ -1.96
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